南海神庙码头遗址位于南海神庙浴日亭南面的河涌东旁。一处是明代古码头遗址,另一处在南海神庙的正门"海不扬波"牌坊前，属清代古码头遗址。该两处遗址已按原状保存。

南海神庙是隋唐以来朝廷祭祀海神的场所，也是南海海上丝绸之路的重要历史见证。庙前发现的清代码头和庙西的临海一面的明代码头、接官亭、官道等石构遗迹，以及明代码头北面发现的北宋长廊、明代放生池等遗迹，是南海神庙历史地理变迁的物证。